Utilizat în general în diferite microscopuri, pentru a permite oamenilor să observe mai ușor diferite fenomene fluorescente. Microscopurile folosite în mod obișnuit cu filtre sunt microscopul fluorescent, microscopul laser, microscopul fluorescent confocal de scanare (LSCM), microscopul confocal și microscopul fluorescent cu reflecție totală internă (TIRFM). Utilizat în principal în domeniul științelor vieții și biomedicii, rolul principal este de a separa și selecta substanțele în sistemele de analiză a fluorescenței biomedicale în spectrul caracteristic al luminii excitate și al fluorescenței emise.